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35 蛋白质超二级结构和结构域pdfDogecoin - An open-source peer-to-er digital currency

作者:小编2025-01-17 10:22:52

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  1、蛋白质超蛋白质超二级结构二级结构和和结构域结构域一.基本概念蛋白质的超二级结构超二级结构:也称之基元(motif)指相邻的二级结构单元组合在一起,彼此相互作指相邻的二级结构单元组合在一起,彼此相互作用,排列形成规则的、在空间结构上能够辨认的二级结用,排列形成规则的、在空间结构上能够辨认的二级结构组合体,并充当三级结构的构件(构组合体,并充当三级结构的构件(block building)。)。超二级结构类型希腊钥匙拓扑结构希腊钥匙拓扑结构二.超二级结构类型蛋白质的超二级结构1.复绕-helix():两两条或多条条或多条-helixhelix沿同一沿同一轴形成轴形成左左手超螺旋,疏水力手超螺旋,疏

  2、水力维持。维持。平行平行或反平行,重复单位或反平行,重复单位14nm14nm。存在存在:-角蛋白;角蛋白;TMVTMV衣壳衣壳蛋白。蛋白。二.超二级结构类型两股两股-sheet中间通过不确定单元中间通过不确定单元(有规则二级结构有规则二级结构)联接在一起联接在一起 主要形式主要形式:,c,(Rossman折叠折叠等)等)具有手性:右手扭曲具有手性:右手扭曲(right-handed twist)2.单元:二.超二级结构类型 三个以上相邻三个以上相邻-sheet通过短链连接形成。通过短链连接形成。3.-迂回(-meander):三个三个(-meander)四个四个(希腊钥匙)(希腊钥匙)五个五个

  3、(双希腊钥匙)(双希腊钥匙)二.超二级结构类型4.-折叠筒(-sheet barrel)(1)印第安花蓝:印第安花蓝:如如 木瓜蛋白酶木瓜蛋白酶(2)希腊钥匙:希腊钥匙:如如 胰凝乳蛋白酶胰凝乳蛋白酶(3)闪电结构闪电结构如如 磷酸丙糖异构酶磷酸丙糖异构酶二.超二级结构类型5.-helix-turn-helix:某些噬菌体的某些噬菌体的 阻遏蛋白分子中阻遏蛋白分子中的操纵子结合部位;的操纵子结合部位;CuCu-Zn SODZn SOD;木瓜蛋白酶;木瓜蛋白酶;胰凝乳蛋白酶等胰凝乳蛋白酶等是蛋白质与DNA相互作用的主要方式之一。-helix-turn-helix二.超二级结构类型5.-helix

  4、-turn-helix:EF手相结构手相结构EF手相:钙结合蛋白中,含有Helix-Loop-Lelix结构。锌指:DNA结合蛋白中,2个His、2个Cys结合一个Zn。亮氨酸拉链:DNA结合蛋白中,由亮氨酸倒链形成的拉链式结构。1、结构域的概念结构19701970年年EdelmanEdelman为了描述免疫球蛋白分子的结构为了描述免疫球蛋白分子的结构,提出了结构域的概念。提出了结构域的概念。结构结构域域是指在较大蛋白质分子中,由于多肽链上相邻的超二级结构紧是指在较大蛋白质分子中,由于多肽链上相邻的超二级结构紧密联系,形成二个或多个在空间上可以明显区别的局部区域(一般为球密联系,形成二个或多个

  6、结构域溶血素的一个结构域扭曲的折叠片层链的两种排列是由这些链的扭曲趋势来链的两种排列是由这些链的扭曲趋势来稳定。稳定。光解酶的一个结构域光解酶的一个结构域肌钙蛋白肌钙蛋白C的结构域的结构域 两个分离的钙结构域两个分离的钙结构域2.结构域与功能域3.结构域的运动 功能域功能域:是蛋白质分子中能独立存在的功能单位是蛋白质分子中能独立存在的功能单位,它可以由一个或多个结构域它可以由一个或多个结构域组成。组成。关系关系:功能域往往位于结构域之间的交界处,可以由功能域往往位于结构域之间的交界处,可以由2 2个或个或2 2个以上的结构个以上的结构域组成。域组成。每个每个结构域本身都是紧密装配的,结构域之间

  7、是通过共价的、松散的肽结构域本身都是紧密装配的,结构域之间是通过共价的、松散的肽链相联系的,由于这种牢固而又柔韧的连接方式,使得每一个结构域可以作链相联系的,由于这种牢固而又柔韧的连接方式,使得每一个结构域可以作为一个整体做较大幅度的相对运动为一个整体做较大幅度的相对运动。当当底物与酶结合时,底物与酶结合时,2 2个结构域会发生相对运动,使裂缝关闭,结构域的个结构域会发生相对运动,使裂缝关闭,结构域的这种运动可以使催化基团定向地包围底物,辨认出不合适的底物,并从活性这种运动可以使催化基团定向地包围底物,辨认出不合适的底物,并从活性部位上排出水分子。部位上排出水分子。4.结构域的类型(1)反平行

  8、 域:-helix按一定方式排列折叠上下型螺旋束上下型螺旋束:如四螺旋束,上下摆放,如四螺旋束,上下摆放,如:蚯蚓血红蛋白,如:蚯蚓血红蛋白,Cyt b562,TMV蛋白蛋白珠蛋白型珠蛋白型-螺旋螺旋(Greek key螺旋束螺旋束):相邻的两螺旋接近相互垂直相邻的两螺旋接近相互垂直如如:血红蛋白、肌红蛋白、木瓜蛋白酶血红蛋白、肌红蛋白、木瓜蛋白酶血红蛋白血红蛋白4.结构域的类型(2)反平行 /域:肽链按肽链按RossmanRossman折叠方式折叠方式单向单向卷绕而成的闭卷绕而成的闭合式圆桶合式圆桶结构结构马鞍形扭曲片:由由 片扭曲成马鞍形片扭曲成马鞍形,-螺旋分处扭曲片的螺旋分处扭曲片的两侧两侧4.结构域的类型(3)反平行-域:上下反平行上下反平行-筒筒Greek key 开放式三明治开放式三明治4.结构域的类型(4)富含二硫键及金属的小蛋白结构域 一般小于一般小于100aa残基残基 结构域不规则结构域不规则 很少量二级结构很少量二级结构 富含金属或二硫键富含金属或二硫键有稳定结构域作用有稳定结构域作用谢谢大家蛋白质的超蛋白质的超二级结构和二级结构和结构域结构域